De 3e etappe ging van start vanaf het Gustav Mahlerplein in Amsterdam en kwam na anderhalf uur via de Oegstgeestweg aan in Leiden. Tom Stamsnijder (Rabobank), Olivier Kaisen (Lotto) en Jerome Pineau (Quick-Step) reden als eerste wielrenners van het peloton Leiden binnen via de Schipholweg.
De drie renners vluchten na 20 kilometer uit het peloton en creëerden een voorsprong van 5 minuten.
De route vervolgt zich door naar de Schipholweg, Morssingel, Steenstraat, Prinsessekade, Kort Rapenburg, Breestraat, Korevaarstraat, Lammenschansweg en via de Europaweg verlaten de renners Leiden.
De renners vervolgen hun weg via Delft en Rotterdam. Na bijna tweeëneenhalf uur slokt het peloton de drie koplopers op en vervolgen zij hun weg over de Oosterschelde. Na een valpartij van van de Velde , Bruseghin en Sabatini rijden de wielrenners de dijk op en breekt het peloton op. Later zijn ook Wiggins en Evans betrokken bij een valpartij. Basso, Vinokoerov en Garzalli vormen de kop van het peloton en zetten twee kilometer voor de finish in Middelburg de eindsprint in. De Belg Wouter Weylandt wint de sprint net voor Rabo-renner Graeme Brown.
